皆様
下記の要領で、本年度の先導研 研究指導者 松永康佑先生の講演会を開催いたします。
ご多忙の折と存じますが、皆様のご来聴をお待ちしております。
森
皆様
下記の要領で、本年度の先導研 研究指導者 松永康佑先生の講演会を開催いたします。
ご多忙の折と存じますが、皆様のご来聴をお待ちしております。
森
2024年11月21日(木)
15:00 ~ 16:30
日 時 : 2024年11月21日(木) 15:00〜16:30
場 所 : 先導物質化学研究所(筑紫キャンパス) 中央棟111セミナー室
講 師 : 松永 康佑 先生 (埼玉大学大学院理工学研究科・准教授)
題 目 : 「機械学習を活用した生体分子動態モデリング」
要 旨:
生体分子の構造の動き(動態)は分子機能と密接に関わっており、それらの分子機能を深く理解するにはその動態の詳細を観察することが重要である。動態を調べるには分子動力学シミュレーションや1分子計測実験が強力な手法であるが、シミュレーションから得られる複雑な時系列データ(トラジェクトリ)をどう縮約して解釈するか、シミュレーションと実験データを整合的にモデリングしてどのように動態を理解するか、という課題がある。これらの課題は広く見れば、機械学習における教師なし学習や自己教師あり学習のタスクの一つとして捉えることができる。本セミナーでは、最初に教師なし学習の基礎(周辺尤度やELBO)を振り返った上で、最近の我々の機械学習の応用例(トラジェクトリの次元縮約[1]、AFMデータモデリング[2, 3])と現在進行中の応用例を紹介したい。
[1] T. Ishizone, et al., J. Chem. Theory Comput. 20, 436-450 (2024).
[2] Y. Matsunaga, Sci. Rep. 13, 129 (2023).
[3] T. Ogane, et al., PLoS Comput. Biol. 18, e1010384 (2022).
森
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Toshifumi Mori
Institute for Materials Chemistry and Engineering
Kyushu University
6-1 Kasuga-koen
Kasuga, Fukuoka, 816-8580
Japan
phone: +81-92-583-7800
email: toshi_mori@cm.kyushu-u.ac.jp
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